EQUIVALENCE NTRM H NTRM HT NTRM HN1 NTRM HT1 NTRM HN2 NTRM HT2 NTRM HN3 NTRM HT3 NTRP H NTRP HT NTRP HN1 NTRP HT1 NTRP HN2 NTRP HT2 NTRO HN NTRO H NTRO HN1 NTRO HT1 NTRO HN2 NTRO HT2 NTRO HN3 NTRO HT3 NTPO HN NTPO H NTPO HN1 NTPO HT1 NTPO HN2 NTPO HT2 CTRM HN CTRM H CTRM O1 CTRM OT1 CTRM O2 CTRM OT2 CTRM O CTRM OT1 CTRM OXT CTRM OT2 CTRP HN CTRP H CTRP O1 CTRP OT1 CTRP O2 CTRP OT2 CTRO HN CTRO H CTRO O1 CTRO OT1 CTRO O2 CTRO OT2 CTPO HN CTPO H CTPO O1 CTPO OT1 CTPO O2 CTPO OT2 HIS N HID N HIS H HID H HIS CA HID CA HIS CB HID CB HIS CG HID CG HIS ND1 HID ND1 HIS HD1 HID HD1 HIS CD2 HID CD2 HIS CE1 HID CE1 HIS NE2 HID NE2 HIS C HID C HIS O HID O HISA N HID N HISA H HID H HISA CA HID CA HISA CB HID CB HISA CG HID CG HISA ND1 HID ND1 HISA HD1 HID HD1 HISA CD2 HID CD2 HISA CE1 HID CE1 HISA NE2 HID NE2 HISA C HID C HISA O HID O HISB N HIE N HISB H HIE H HISB CA HIE CA HISB CB HIE CB HISB CG HIE CG HISB ND1 HIE ND1 HISB CD2 HIE CD2 HISB CE1 HIE CE1 HISB NE2 HIE NE2 HISB HE2 HIE HE2 HISB C HIE C HISB O HIE O LYSH N LYS N LYSH H LYS H LYSH CA LYS CA LYSH CB LYS CB LYSH CG LYS CG LYSH CD LYS CD LYSH CE LYS CE LYSH NZ LYS NZ LYSH HZ1 LYS HZ1 LYSH HZ2 LYS HZ2 LYSH HZ3 LYS HZ3 LYSH C LYS C LYSH O LYS O CYS1 N CYX N CYS1 H CYX H CYS1 CA CYX CA CYS1 C CYX C CYS1 O CYX O CYS1 CB CYX CB CYS1 SG CYX SG CYS2 N CYX N CYS2 H CYX H CYS2 CA CYX CA CYS2 C CYX C CYS2 O CYX O CYS2 CB CYX CB CYS2 SG CYX SG CYS N CYX N CYS H CYX H CYS CA CYX CA CYS C CYX C CYS O CYX O CYS CB CYX CB CYS SG CYX SG ALA HN ALA H ARG HN ARG H ARG HNE ARG HE ARG HN11 ARG HH11 ARG HN12 ARG HH12 ARG HH1 ARG HH11 ARG HN21 ARG HH21 ARG HN22 ARG HH22 ARG HH2 ARG HH21 ASN HN ASN H ASN HND1 ASN HD21 ASN HND2 ASN HD22 ASN HH21 ASN HD21 ASN HH22 ASN HD22 ASN HD2 ASN HD21 ASP HN ASP H CYSP HN CYSP H CYSP HSG CYSP HG CYX HN CYX H GLN HN GLN H GLN HNE1 GLN HE21 GLN HNE2 GLN HE22 GLN HH21 GLN HE21 GLN HH22 GLN HE22 GLN HE2 GLN HE21 GLU HN GLU H GLY HN GLY H HID HN HID H HID HND HID HD1 HIE HN HIE H HIE HNE HIE HE2 HI2 HN HI2 H HI2 HND HI2 HD1 HI2 HNE HI2 HE1 HIP HN HI2 H HIP HND HI2 HD1 HIP HNE HI2 HE2 HIP N HI2 N HIP H HI2 H HIP CA HI2 CA HIP CB HI2 CB HIP CG HI2 CG HIP ND1 HI2 ND1 HIP HD1 HI2 HD1 HIP CE1 HI2 CE1 HIP NE2 HI2 NE2 HIP HE2 HI2 HE2 HIP CD2 HI2 CD2 HIP C HI2 C HIP O HI2 O HYL HN HYL H HYL HNZ1 HYL HZ1 HYL HNZ2 HYL HZ2 HYL HNZ3 HYL HZ3 ILE HN ILE H ILE CD ILE CD1 LEU HN LEU H LYS HN LYS H LYS HNZ1 LYS HZ1 LYS HNZ2 LYS HZ2 LYS HNZ3 LYS HZ3 MET HN MET H PHE HN PHE H SER HN SER H SER HOG SER HG THR HN THR H THR HOG THR HG1 TRP HN TRP H TYR HN TYR H TYR HOH TYR HH VAL HN VAL H OPLS resi atom chrg epsi sigm radi end ! The radii are half sigma. DUM POS 1.000 0.000 0.000 1.500 DUM NEG -1.000 0.000 0.000 1.500 DUM C4 0.000 0.000 0.000 0.000 ! Dummy atom for TIM BD simulations DUM PO 0.000 0.000 0.000 0.000 ! Dummy atom for TIM BD simulations NTRM HT 0.330 0.000 0.000 1.200 NTRM HT1 0.330 0.000 0.000 1.200 NTRM HT2 0.330 0.000 0.000 1.200 ! 2^(-5/6) = 0.561231 NTRM HT3 0.330 0.000 0.000 1.200 NTRM N -0.300 0.170 3.250 1.625 NTRM CA 0.310 0.080 3.800 1.900 NTRM C 0.500 0.105 3.750 1.875 NTRM O -0.500 0.210 2.960 1.480 NTRP HT 0.330 0.000 0.000 1.200 ! AMBER NTRP values NTRP HT1 0.330 0.000 0.000 1.200 ! AMBER NTRP values NTRP HT2 0.330 0.000 0.000 1.200 NTRP N -0.300 0.170 3.250 1.625 NTRP CA 0.330 0.080 3.800 1.900 NTRP CD 0.310 0.118 3.800 1.900 NTRP C 0.500 0.105 3.750 1.875 NTRP O -0.500 0.210 2.960 1.480 NTRO HT1 0.100 0.000 0.000 1.200 ! Neutral N-terminus; NTRO HT2 0.100 0.000 0.000 1.200 NTRO HT3 0.100 0.000 0.000 1.200 NTRO N -0.300 0.170 3.250 1.625 NTRO CA 0.000 0.080 3.800 1.900 NTRO C 0.500 0.105 3.750 1.875 NTRO O -0.500 0.210 2.960 1.480 NTPO HT1 0.100 0.000 0.000 1.200 ! Neutral PRO N-terminus; NTPO HT2 0.100 0.000 0.000 1.200 NTPO N -0.300 0.170 3.250 1.625 NTPO CA 0.100 0.080 3.800 1.900 NTPO CD 0.000 0.118 3.800 1.900 NTPO C 0.500 0.105 3.750 1.875 NTPO O -0.500 0.210 2.960 1.480 HOH O -0.820 0.000 0.000 1.480 ! For TIP3P water HOH HW 0.410 0.000 0.000 1.200 ! For TIP3P water HOH ODU 0.000 0.000 0.000 1.480 ! For dummy TIP3P water HOH HDU 0.000 0.000 0.000 1.200 ! For dummy TIP3P water CTRM OT1 -0.800 0.210 2.960 1.480 CTRM OT2 -0.800 0.210 2.960 1.480 CTRM N -0.570 0.170 3.250 1.625 CTRM H 0.370 0.000 0.000 1.200 CTRM CA 0.100 0.080 3.800 1.900 CTRM C 0.700 0.105 3.750 1.875 CTRP OT1 -0.800 0.210 2.960 1.480 ! AMBER CTRP values CTRP OT2 -0.800 0.210 2.960 1.480 CTRP N -0.570 0.170 3.250 1.625 CTRP CA 0.185 0.080 3.800 1.900 CTRP C 0.700 0.105 3.750 1.875 CTRP CD 0.285 0.118 3.800 1.900 CTRO OT1 -0.350 0.210 2.960 1.480 ! Neutral N-terminus; CTRO OT2 -0.350 0.210 2.960 1.480 CTRO N -0.570 0.170 3.250 1.625 CTRO H 0.370 0.000 0.000 1.200 CTRO CA 0.200 0.080 3.800 1.900 CTRO C 0.700 0.105 3.750 1.875 CTPO OT1 -0.350 0.210 2.960 1.480 ! Neutral PRO N-terminus; CTPO OT2 -0.350 0.210 2.960 1.480 CTPO N -0.570 0.170 3.250 1.625 CTPO CA 0.235 0.080 3.800 1.900 CTPO C 0.700 0.105 3.750 1.875 CTPO CD 0.335 0.118 3.800 1.900 ALA N -0.570 0.170 3.250 1.625 ALA H 0.370 0.000 0.000 1.200 ALA CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ALA CB 0.000 0.160 3.910 1.955 ALA C 0.500 0.105 3.750 1.875 ALA O -0.500 0.210 2.960 1.480 ARG N -0.570 0.170 3.250 1.625 ARG H 0.370 0.000 0.000 1.200 ARG CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ARG CB 0.000 0.118 3.905 1.952 ARG CG 0.070 0.118 3.905 1.952 ARG CD 0.310 0.118 3.905 1.952 ARG NE -0.700 0.170 3.250 1.625 ARG HE 0.440 0.000 0.000 1.200 ARG CZ 0.640 0.050 2.250 1.125 ARG NH1 -0.800 0.170 3.250 1.625 ARG HH11 0.460 0.000 0.000 1.200 ARG HH12 0.460 0.000 0.000 1.200 ARG NH2 -0.800 0.170 3.250 1.625 ARG HH21 0.460 0.000 0.000 1.200 ARG HH22 0.460 0.000 0.000 1.200 ARG C 0.500 0.105 3.750 1.875 ARG O -0.500 0.210 2.960 1.480 ARO N -0.570 0.170 3.250 1.625 ! Neutral ARG; ARO H 0.370 0.000 0.000 1.200 ARO CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ARO CB 0.000 0.118 3.905 1.952 ARO CG 0.000 0.118 3.905 1.952 ARO CD 0.200 0.118 3.905 1.952 ARO NE -0.570 0.170 3.250 1.625 ARO HE 0.350 0.000 0.000 1.200 ARO CZ 0.020 0.050 2.250 1.125 ARO NH1 -0.440 0.170 3.250 1.625 ARO HH11 0.220 0.000 0.000 1.200 ARO HH12 0.220 0.000 0.000 1.200 ARO NH2 -0.440 0.170 3.250 1.625 ARO HH21 0.220 0.000 0.000 1.200 ARO HH22 0.220 0.000 0.000 1.200 ARO C 0.500 0.105 3.750 1.875 ARO O -0.500 0.210 2.960 1.480 ASN N -0.570 0.170 3.250 1.625 ASN H 0.370 0.000 0.000 1.200 ASN CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ASN CB 0.000 0.118 3.905 1.952 ASN CG 0.500 0.105 3.750 1.875 ASN OD1 -0.500 0.210 2.960 1.480 ASN ND2 -0.850 0.170 3.250 1.625 ASN HD21 0.425 0.000 0.000 1.200 ASN HD22 0.425 0.000 0.000 1.200 ASN C 0.500 0.105 3.750 1.875 ASN O -0.500 0.210 2.960 1.480 ASP N -0.570 0.170 3.250 1.625 ASP H 0.370 0.000 0.000 1.200 ASP HD 1.000 0.000 0.000 1.200 ! to neutralize in case ASP CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ASP CB -0.100 0.118 3.905 1.952 ASP CG 0.700 0.105 3.750 1.875 ASP OD1 -0.800 0.210 2.960 1.480 ASP OD2 -0.800 0.210 2.960 1.480 ASP C 0.500 0.105 3.750 1.875 ASP O -0.500 0.210 2.960 1.480 ASO N -0.570 0.170 3.250 1.625 ! Neutral ASP; ASO H 0.370 0.000 0.000 1.200 ASO CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ASO CB 0.000 0.118 3.905 1.952 ASO CG 0.700 0.105 3.750 1.875 ASO OD1 -0.350 0.210 2.960 1.480 ASO OD2 -0.350 0.210 2.960 1.480 ASO C 0.500 0.105 3.750 1.875 ASO O -0.500 0.210 2.960 1.480 CYSP N -0.570 0.170 3.250 1.625 CYSP H 0.370 0.000 0.000 1.200 CYSP CA 0.200 0.080 3.800 1.900 CYSP CB 0.180 0.118 3.905 1.952 CYSP SG -0.450 0.250 3.550 1.775 CYSP HG 0.270 0.000 0.000 1.200 CYSP C 0.500 0.105 3.750 1.875 CYSP O -0.500 0.210 2.960 1.480 CYX N -0.570 0.170 3.250 1.625 CYX H 0.370 0.000 0.000 1.200 CYX CA 0.200 0.080 3.800 1.900 CYX CB 0.300 0.118 3.800 1.900 CYX SG -0.300 0.250 3.550 1.775 CYX C 0.500 0.105 3.750 1.875 CYX O -0.500 0.210 2.960 1.480 GLN N -0.570 0.170 3.250 1.625 GLN H 0.370 0.000 0.000 1.200 GLN CA 0.200 0.080 3.800 1.900 GLN CB 0.000 0.118 3.905 1.952 GLN CG 0.000 0.118 3.905 1.952 GLN CD 0.500 0.105 3.750 1.875 GLN OE1 -0.500 0.210 2.960 1.480 GLN NE2 -0.850 0.170 3.250 1.625 GLN HE21 0.425 0.000 0.000 1.200 GLN HE22 0.425 0.000 0.000 1.200 GLN C 0.500 0.105 3.750 1.875 GLN O -0.500 0.210 2.960 1.480 GLU N -0.570 0.170 3.250 1.625 GLU H 0.370 0.000 0.000 1.200 GLU CA 0.200 0.080 3.800 1.900 GLU CB 0.000 0.118 3.905 1.952 GLU CG -0.100 0.118 3.905 1.952 GLU CD 0.700 0.105 3.750 1.875 GLU OE1 -0.800 0.210 2.960 1.480 GLU OE2 -0.800 0.210 2.960 1.480 GLU C 0.500 0.105 3.750 1.875 GLU O -0.500 0.210 2.960 1.480 GLO N -0.570 0.170 3.250 1.625 ! Neutral GLU; GLO H 0.370 0.000 0.000 1.200 GLO CA 0.200 0.080 3.800 1.900 GLO CB 0.000 0.118 3.905 1.952 GLO CG 0.000 0.118 3.905 1.952 GLO CD 0.700 0.105 3.750 1.875 GLO OE1 -0.350 0.210 2.960 1.480 GLO OE2 -0.350 0.210 2.960 1.480 GLO C 0.500 0.105 3.750 1.875 GLO O -0.500 0.210 2.960 1.480 GLY N -0.570 0.170 3.250 1.625 GLY H 0.370 0.000 0.000 1.200 GLY CA 0.200 0.118 3.800 1.900 GLY C 0.500 0.105 3.750 1.875 GLY O -0.500 0.210 2.960 1.480 HID N -0.570 0.170 3.250 1.625 HID H 0.370 0.000 0.000 1.200 HID CA 0.200 0.080 3.800 1.900 HID CB 0.000 0.118 3.905 1.952 HID CG 0.130 0.145 3.750 1.875 HID ND1 -0.570 0.170 3.250 1.625 HID HD1 0.420 0.000 0.000 1.200 HID CE1 0.410 0.145 3.750 1.875 HID NE2 -0.490 0.170 3.250 1.625 HID CD2 0.100 0.145 3.750 1.875 HID C 0.500 0.105 3.750 1.875 HID O -0.500 0.210 2.960 1.480 HIE N -0.570 0.170 3.250 1.625 HIE H 0.370 0.000 0.000 1.200 HIE CA 0.200 0.080 3.800 1.900 HIE CB 0.000 0.118 3.905 1.952 HIE CG 0.100 0.145 3.750 1.875 HIE ND1 -0.490 0.170 3.250 1.625 HIE CE1 0.410 0.145 3.750 1.875 HIE NE2 -0.570 0.170 3.250 1.625 HIE HE2 0.420 0.000 0.000 1.200 HIE CD2 0.130 0.145 3.750 1.875 HIE C 0.500 0.105 3.750 1.875 HIE O -0.500 0.210 2.960 1.480 HI2 N -0.570 0.170 3.250 1.625 HI2 H 0.370 0.000 0.000 1.200 HI2 CA 0.200 0.080 3.800 1.900 HI2 CB 0.000 0.118 3.905 1.952 HI2 CG 0.330 0.145 3.750 1.875 HI2 ND1 -0.540 0.170 3.250 1.625 HI2 HD1 0.460 0.000 0.000 1.200 HI2 CE1 0.500 0.145 3.750 1.875 HI2 NE2 -0.540 0.170 3.250 1.625 HI2 HE2 0.460 0.000 0.000 1.200 HI2 CD2 0.330 0.145 3.750 1.875 HI2 C 0.500 0.105 3.750 1.875 HI2 O -0.500 0.210 2.960 1.480 HYP N -0.570 0.170 3.250 1.625 HYP CA 0.285 0.080 3.800 1.900 HYP CB 0.000 0.118 3.905 1.952 HYP CG 0.265 0.080 3.850 1.925 HYP CD 0.285 0.118 3.800 1.900 HYP OD -0.700 0.170 3.070 1.535 HYP HD 0.435 0.000 0.000 1.200 HYP C 0.500 0.105 3.750 1.875 HYP O -0.500 0.210 2.960 1.480 HYL N -0.570 0.170 3.250 1.625 HYL H 0.370 0.000 0.000 1.200 HYL CA 0.200 0.080 3.800 1.900 HYL CB 0.000 0.118 3.905 1.952 HYL CG 0.000 0.118 3.905 1.952 HYL CD 0.265 0.080 3.850 1.925 HYL OE1 -0.700 0.170 3.070 1.535 HYL HE1 0.435 0.000 0.000 1.200 HYL CE 0.310 0.118 3.905 1.952 HYL NZ -0.300 0.170 3.250 1.625 HYL HZ1 0.330 0.000 0.000 1.200 HYL HZ2 0.330 0.000 0.000 1.200 HYL HZ3 0.330 0.000 0.000 1.200 HYL C 0.500 0.105 3.750 1.875 HYL O -0.500 0.210 2.960 1.480 ILE N -0.570 0.170 3.250 1.625 ILE H 0.370 0.000 0.000 1.200 ILE CA 0.200 0.080 3.800 1.900 ILE CB 0.000 0.080 3.850 1.925 ILE CG1 0.000 0.118 3.905 1.952 ILE CG2 0.000 0.160 3.910 1.955 ILE CD1 0.000 0.175 3.905 1.952 ILE C 0.500 0.105 3.750 1.875 ILE O -0.500 0.210 2.960 1.480 LEU N -0.570 0.170 3.250 1.625 LEU H 0.370 0.000 0.000 1.200 LEU CA 0.200 0.080 3.800 1.900 LEU CB 0.000 0.118 3.905 1.952 LEU CG 0.000 0.080 3.850 1.925 LEU CD1 0.000 0.160 3.910 1.955 LEU CD2 0.000 0.160 3.910 1.955 LEU C 0.500 0.105 3.750 1.875 LEU O -0.500 0.210 2.960 1.480 LYS N -0.570 0.170 3.250 1.625 LYS H 0.370 0.000 0.000 1.200 LYS CA 0.200 0.080 3.800 1.900 LYS CB 0.000 0.118 3.905 1.952 LYS CG 0.000 0.118 3.905 1.952 LYS CD 0.000 0.118 3.905 1.952 LYS CE 0.310 0.118 3.905 1.952 LYS NZ -0.300 0.170 3.250 1.625 LYS HZ1 0.330 0.000 0.000 1.200 LYS HZ2 0.330 0.000 0.000 1.200 LYS HZ3 0.330 0.000 0.000 1.200 LYS C 0.500 0.105 3.750 1.875 LYS O -0.500 0.210 2.960 1.480 LYO N -0.570 0.170 3.250 1.625 ! Neutral LYS; LYO H 0.370 0.000 0.000 1.200 LYO CA 0.200 0.080 3.800 1.900 LYO CB 0.000 0.118 3.905 1.952 LYO CG 0.000 0.118 3.905 1.952 LYO CD 0.000 0.118 3.905 1.952 LYO CE 0.000 0.118 3.905 1.952 LYO NZ -0.300 0.170 3.250 1.625 LYO HZ1 0.100 0.000 0.000 1.200 LYO HZ2 0.100 0.000 0.000 1.200 LYO HZ3 0.100 0.000 0.000 1.200 LYO C 0.500 0.105 3.750 1.875 LYO O -0.500 0.210 2.960 1.480 MET N -0.570 0.170 3.250 1.625 MET H 0.370 0.000 0.000 1.200 MET CA 0.200 0.080 3.800 1.900 MET CB 0.000 0.118 3.905 1.952 MET CG 0.235 0.118 3.800 1.900 MET SD -0.470 0.250 3.550 1.775 MET CE 0.235 0.170 3.800 1.900 MET C 0.500 0.105 3.750 1.875 MET O -0.500 0.210 2.960 1.480 PHE N -0.570 0.170 3.250 1.625 PHE H 0.370 0.000 0.000 1.200 PHE CA 0.200 0.080 3.800 1.900 PHE CB 0.000 0.118 3.905 1.952 PHE CG 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE CD1 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE CE1 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE CZ 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE CE2 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE CD2 0.000 0.110 3.750 1.875 PHE C 0.500 0.105 3.750 1.875 PHE O -0.500 0.210 2.960 1.480 PRO N -0.570 0.170 3.250 1.625 PRO CD 0.285 0.118 3.800 1.900 PRO CG 0.000 0.118 3.905 1.952 PRO CB 0.000 0.118 3.905 1.952 PRO CA 0.285 0.080 3.800 1.900 PRO C 0.500 0.105 3.750 1.875 PRO O -0.500 0.210 2.960 1.480 SER N -0.570 0.170 3.250 1.625 SER H 0.370 0.000 0.000 1.200 SER CA 0.200 0.080 3.800 1.900 SER CB 0.265 0.118 3.905 1.952 SER OG -0.700 0.170 3.070 1.535 SER HG 0.435 0.000 0.000 1.200 SER C 0.500 0.105 3.750 1.875 SER O -0.500 0.210 2.960 1.480 THR N -0.570 0.170 3.250 1.625 THR H 0.370 0.000 0.000 1.200 THR CA 0.200 0.080 3.800 1.900 THR CB 0.265 0.080 3.850 1.925 THR CG2 0.000 0.160 3.910 1.955 THR OG1 -0.700 0.170 3.070 1.535 THR HG1 0.435 0.000 0.000 1.200 THR C 0.500 0.105 3.750 1.875 THR O -0.500 0.210 2.960 1.480 TRP N -0.570 0.170 3.250 1.625 TRP H 0.370 0.000 0.000 1.200 TRP CA 0.200 0.080 3.800 1.900 TRP CB 0.000 0.118 3.905 1.952 TRP CG -0.055 0.145 3.750 1.875 TRP CD1 0.130 0.145 3.750 1.875 TRP NE1 -0.570 0.170 3.250 1.625 TRP HE1 0.420 0.000 0.000 1.200 TRP HNE 0.420 0.000 0.000 1.200 TRP CE2 0.130 0.145 3.750 1.875 TRP CZ2 0.000 0.110 3.750 1.875 TRP CH2 0.000 0.110 3.750 1.875 TRP CZ3 0.000 0.110 3.750 1.875 TRP CE3 0.000 0.110 3.750 1.875 TRP CD2 -0.055 0.145 3.750 1.875 TRP C 0.500 0.105 3.750 1.875 TRP O -0.500 0.210 2.960 1.480 TYR N -0.570 0.170 3.250 1.625 TYR H 0.370 0.000 0.000 1.200 TYR CA 0.200 0.080 3.800 1.900 TYR CB 0.000 0.118 3.905 1.952 TYR CG 0.000 0.110 3.750 1.875 TYR CD1 0.000 0.110 3.750 1.875 TYR CE1 0.000 0.110 3.750 1.875 TYR CZ 0.265 0.110 3.750 1.875 TYR OH -0.700 0.170 3.070 1.535 TYR HH 0.435 0.000 0.000 1.200 TYR CE2 0.000 0.110 3.750 1.875 TYR CD2 0.000 0.110 3.750 1.875 TYR C 0.500 0.105 3.750 1.875 TYR O -0.500 0.210 2.960 1.480 VAL N -0.570 0.170 3.250 1.625 VAL H 0.370 0.000 0.000 1.200 VAL CA 0.200 0.080 3.800 1.900 VAL CB 0.000 0.080 3.850 1.925 VAL CG1 0.000 0.160 3.910 1.955 VAL CG2 0.000 0.160 3.910 1.955 VAL C 0.500 0.105 3.750 1.875 VAL O -0.500 0.210 2.960 1.480 NEG TST5 -1.000 0.000 0.000 0.500 POS TST5 1.000 0.000 0.000 0.500 NEU TST5 0.000 0.000 0.000 0.500 GAP PO -1.700 0.000 0.000 2.00 GAP NP -0.300 0.000 0.000 2.00 GAP POLR -1.700 0.000 0.000 2.00 GAP NPLR -0.300 0.000 0.000 2.00 GAPH PO -0.850 0.000 0.000 2.00 GAPH NP -0.150 0.000 0.000 2.00 GAP MN -2.000 0.000 0.000 2.50 GAPH MN -1.000 0.000 0.000 2.50 BUT CH3 0.000 0.000 0.000 1.85 BUT CH2 0.000 0.000 0.000 1.85 WAT OW -0.830 0.210 2.960 1.480 WAT HW1 0.415 0.000 0.000 1.200 WAT HW2 0.415 0.000 0.000 1.200 AMBER resi atom chrg epsi sigm radi end DADE O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 DADE C5' 0.153 0.100 3.421 1.711 DADE C4' 0.185 0.000 3.296 1.648 DADE O1' -0.386 0.100 2.940 1.470 DADE C1' 0.500 0.000 3.296 1.648 DADE N9 -0.457 0.100 3.029 1.515 DADE C8 0.488 0.000 3.296 1.648 DADE N7 -0.599 0.100 3.029 1.515 DADE C5 -0.151 0.100 3.296 1.648 DADE C6 0.813 0.100 3.296 1.648 DADE N6 -0.793 0.100 3.029 1.515 DADE HN6A 0.335 0.020 1.782 0.891 DADE HN6B 0.339 0.020 1.782 0.891 DADE N1 -0.760 0.100 3.029 1.515 DADE C2 0.571 0.000 3.296 1.648 DADE N3 -0.717 0.100 3.029 1.515 DADE C4 0.695 0.100 3.296 1.648 DADE C3' 0.172 0.000 3.296 1.648 DADE C2' -0.047 0.100 3.421 1.711 DADE O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 RADE O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 RADE C5' 0.175 0.100 3.421 1.711 RADE C4' 0.197 0.000 3.296 1.648 RADE O1' -0.413 0.100 2.940 1.470 RADE C1' 0.522 0.000 3.296 1.648 RADE N9 -0.457 0.100 3.029 1.515 RADE C8 0.488 0.000 3.296 1.648 RADE N7 -0.599 0.100 3.029 1.515 RADE C5 -0.151 0.100 3.296 1.648 RADE C6 0.813 0.100 3.296 1.648 RADE N6 -0.793 0.100 3.029 1.515 RADE HN6A 0.335 0.020 1.782 0.891 RADE HN6B 0.339 0.020 1.782 0.891 RADE N1 -0.760 0.100 3.029 1.515 RADE C2 0.571 0.000 3.296 1.648 RADE N3 -0.717 0.100 3.029 1.515 RADE C4 0.695 0.100 3.296 1.648 RADE C3' 0.210 0.000 3.296 1.648 RADE C2' 0.082 0.000 3.296 1.648 RADE O2' -0.512 0.100 2.940 1.470 RADE HO2' 0.316 0.020 1.782 0.891 RADE O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 DTHY O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 DTHY C5' 0.153 0.100 3.421 1.711 DTHY C4' 0.185 0.000 3.296 1.648 DTHY O1' -0.386 0.100 2.940 1.470 DTHY C1' 0.500 0.000 3.296 1.648 DTHY N1 -0.739 0.100 3.029 1.515 DTHY C6 0.551 0.000 3.296 1.648 DTHY C5 -0.595 0.100 3.296 1.648 DTHY C7 0.097 0.100 3.564 1.782 DTHY C4 0.980 0.100 3.296 1.648 DTHY O4 -0.472 0.200 2.851 1.425 DTHY N3 -1.012 0.100 3.029 1.515 DTHY H3 0.370 0.020 1.782 0.891 DTHY C2 1.113 0.100 3.296 1.648 DTHY O2 -0.529 0.200 2.851 1.425 DTHY C3' 0.172 0.000 3.296 1.648 DTHY C2' -0.047 0.100 3.421 1.711 DTHY O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 RURA O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 RURA C5' 0.175 0.100 3.421 1.711 RURA C4' 0.197 0.000 3.296 1.648 RURA O1' -0.413 0.100 2.940 1.470 RURA C1' 0.522 0.000 3.296 1.648 RURA N1 -0.567 0.100 3.029 1.515 RURA C6 0.366 0.000 3.296 1.648 RURA C5 -0.204 0.000 3.296 1.648 RURA C4 0.572 0.100 3.296 1.648 RURA O4 -0.394 0.200 2.851 1.425 RURA N3 -0.758 0.100 3.029 1.515 RURA H3 0.347 0.020 1.782 0.891 RURA C2 0.896 0.100 3.296 1.648 RURA O2 -0.494 0.200 2.851 1.425 RURA C3' 0.210 0.000 3.296 1.648 RURA C2' 0.082 0.000 3.296 1.648 RURA O2' -0.512 0.100 2.940 1.470 RURA HO2' 0.316 0.020 1.782 0.891 RURA O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 DGUA O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 DGUA C5' 0.153 0.100 3.421 1.711 DGUA C4' 0.185 0.000 3.296 1.648 DGUA O1' -0.386 0.100 2.940 1.470 DGUA C1' 0.500 0.000 3.296 1.648 DGUA N9 -0.379 0.100 3.029 1.515 DGUA C8 0.428 0.000 3.296 1.648 DGUA N7 -0.575 0.100 3.029 1.515 DGUA C5 -0.088 0.100 3.296 1.648 DGUA C6 0.714 0.100 3.296 1.648 DGUA O6 -0.459 0.200 2.851 1.425 DGUA N1 -0.746 0.100 3.029 1.515 DGUA H1 0.340 0.020 1.782 0.891 DGUA C2 0.842 0.100 3.296 1.648 DGUA N2 -0.758 0.100 3.029 1.515 DGUA HN2A 0.324 0.020 1.782 0.891 DGUA HN2B 0.333 0.020 1.782 0.891 DGUA N3 -0.702 0.100 3.029 1.515 DGUA C4 0.490 0.100 3.296 1.648 DGUA C3' 0.172 0.000 3.296 1.648 DGUA C2' -0.047 0.100 3.421 1.711 DGUA O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 RGUA O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 RGUA C5' 0.175 0.100 3.421 1.711 RGUA C4' 0.197 0.000 3.296 1.648 RGUA O1' -0.413 0.100 2.940 1.470 RGUA C1' 0.522 0.000 3.296 1.648 RGUA N9 -0.379 0.100 3.029 1.515 RGUA C8 0.428 0.000 3.296 1.648 RGUA N7 -0.575 0.100 3.029 1.515 RGUA C5 -0.088 0.100 3.296 1.648 RGUA C6 0.714 0.100 3.296 1.648 RGUA O6 -0.459 0.200 2.851 1.425 RGUA N1 -0.746 0.100 3.029 1.515 RGUA H1 0.340 0.020 1.782 0.891 RGUA C2 0.842 0.100 3.296 1.648 RGUA N2 -0.758 0.100 3.029 1.515 RGUA HN2A 0.324 0.020 1.782 0.891 RGUA HN2B 0.333 0.020 1.782 0.891 RGUA N3 -0.702 0.100 3.029 1.515 RGUA C4 0.490 0.100 3.296 1.648 RGUA C3' 0.210 0.000 3.296 1.648 RGUA C2' 0.082 0.000 3.296 1.648 RGUA O2' -0.512 0.100 2.940 1.470 RGUA HO2' 0.316 0.020 1.782 0.891 RGUA O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 DCYT O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 DCYT C5' 0.153 0.100 3.421 1.711 DCYT C4' 0.185 0.000 3.296 1.648 DCYT O1' -0.386 0.100 2.940 1.470 DCYT C1' 0.500 0.000 3.296 1.648 DCYT N1 -0.572 0.100 3.029 1.515 DCYT C6 0.377 0.000 3.296 1.648 DCYT C5 -0.230 0.000 3.296 1.648 DCYT C4 0.630 0.100 3.296 1.648 DCYT N4 -0.743 0.100 3.029 1.515 DCYT HN4A 0.335 0.020 1.782 0.891 DCYT HN4B 0.338 0.020 1.782 0.891 DCYT N3 -0.791 0.100 3.029 1.515 DCYT C2 0.938 0.100 3.296 1.648 DCYT O2 -0.518 0.200 2.851 1.425 DCYT C3' 0.172 0.000 3.296 1.648 DCYT C2' -0.047 0.100 3.421 1.711 DCYT O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 RCYT O5' -0.535 0.100 2.940 1.470 RCYT C5' 0.175 0.100 3.421 1.711 RCYT C4' 0.197 0.000 3.296 1.648 RCYT O1' -0.413 0.100 2.940 1.470 RCYT C1' 0.522 0.000 3.296 1.648 RCYT N1 -0.572 0.100 3.029 1.515 RCYT C6 0.377 0.000 3.296 1.648 RCYT C5 -0.230 0.000 3.296 1.648 RCYT C4 0.630 0.100 3.296 1.648 RCYT N4 -0.743 0.100 3.029 1.515 RCYT HN4A 0.335 0.020 1.782 0.891 RCYT HN4B 0.338 0.020 1.782 0.891 RCYT N3 -0.791 0.100 3.029 1.515 RCYT C2 0.938 0.100 3.296 1.648 RCYT O2 -0.518 0.200 2.851 1.425 RCYT C3' 0.210 0.000 3.296 1.648 RCYT C2' 0.082 0.000 3.296 1.648 RCYT O2' -0.512 0.100 2.940 1.470 RCYT HO2' 0.316 0.020 1.782 0.891 RCYT O3' -0.535 0.100 2.940 1.470 OHB H 0.243 0.020 1.782 0.891 OHB O -0.577 0.100 2.940 1.470 DOHE O -0.621 0.100 2.940 1.470 DOHE H 0.226 0.020 1.782 0.891 ROHE O -0.621 0.100 2.940 1.470 ROHE H 0.226 0.020 1.782 0.891 DPOM P 1.429 0.200 3.742 1.871 DPOM OA -0.850 0.200 2.851 1.425 DPOM OB -0.850 0.200 2.851 1.425 RPOM P 1.429 0.200 3.742 1.871 RPOM OA -0.850 0.200 2.851 1.425 RPOM OB -0.850 0.200 2.851 1.425 HB H 0.285 0.020 1.782 0.891 HE H 0.313 0.020 1.782 0.891 NTRM HT1 0.330 0.000 0.000 1.200 ! Taken from OPLS NTRM HT2 0.330 0.000 0.000 1.200 ! Taken from OPLS NTRM HT3 0.330 0.000 0.000 1.200 ! Taken from OPLS NTRM N -0.300 0.170 3.250 1.625 ! Taken from OPLS NTRM CA 0.310 0.080 3.800 1.900 ! Taken from OPLS For GLY epsi=0.118. NTRM C 0.500 0.105 3.750 1.875 ! Taken from OPLS NTRM O -0.500 0.210 2.960 1.480 ! Taken from OPLS CTRM OT1 -0.800 0.210 2.960 1.480 ! Taken from OPLS CTRM OT2 -0.800 0.210 2.960 1.480 ! Taken from OPLS CTRM N -0.570 0.170 3.250 1.625 ! Taken from OPLS CTRM H 0.370 0.000 0.000 1.200 ! Taken from OPLS CTRM CA 0.100 0.080 3.800 1.900 ! Taken from OPLS For GLY epsi=0.118. CTRM C 0.700 0.105 3.750 1.875 ! Taken from OPLS ALA N -0.520 0.100 3.029 1.515 ALA H 0.248 0.020 1.782 0.891 ALA CA 0.215 0.000 3.296 1.648 ALA CB 0.031 0.100 3.564 1.782 ALA C 0.526 0.100 3.296 1.648 ALA O -0.500 0.200 2.851 1.425 GLY N -0.520 0.100 3.029 1.515 GLY H 0.248 0.020 1.782 0.891 GLY CA 0.246 0.100 3.421 1.711 GLY C 0.526 0.100 3.296 1.648 GLY O -0.500 0.200 2.851 1.425 SER N -0.520 0.100 3.029 1.515 SER H 0.248 0.020 1.782 0.891 SER CA 0.292 0.000 3.296 1.648 SER CB 0.194 0.100 3.421 1.711 SER OG -0.550 0.100 2.940 1.470 SER HG 0.310 0.020 1.782 0.891 SER C 0.526 0.100 3.296 1.648 SER O -0.500 0.200 2.851 1.425 THR N -0.520 0.100 3.029 1.515 THR H 0.248 0.020 1.782 0.891 THR CA 0.268 0.000 3.296 1.648 THR CB 0.211 0.000 3.296 1.648 THR CG2 0.007 0.100 3.564 1.782 THR OG1 -0.550 0.100 2.940 1.470 THR HG1 0.310 0.020 1.782 0.891 THR C 0.526 0.100 3.296 1.648 THR O -0.500 0.200 2.851 1.425 LEU N -0.520 0.100 3.029 1.515 LEU H 0.248 0.020 1.782 0.891 LEU CA 0.204 0.000 3.296 1.648 LEU CB 0.016 0.100 3.421 1.711 LEU CG 0.054 0.000 3.296 1.648 LEU CD1 -0.014 0.100 3.564 1.782 LEU CD2 -0.014 0.100 3.564 1.782 LEU C 0.526 0.100 3.296 1.648 LEU O -0.500 0.200 2.851 1.425 ILE N -0.520 0.100 3.029 1.515 ILE H 0.248 0.020 1.782 0.891 ILE CA 0.199 0.000 3.296 1.648 ILE CB 0.030 0.000 3.296 1.648 ILE CG2 0.001 0.100 3.564 1.782 ILE CG1 0.017 0.100 3.421 1.711 ILE CD1 -0.001 0.100 3.564 1.782 ILE C 0.526 0.100 3.296 1.648 ILE O -0.500 0.200 2.851 1.425 VAL N -0.520 0.100 3.029 1.515 VAL H 0.248 0.020 1.782 0.891 VAL CA 0.201 0.000 3.296 1.648 VAL CB 0.033 0.000 3.296 1.648 VAL CG1 0.006 0.100 3.564 1.782 VAL CG2 0.006 0.100 3.564 1.782 VAL C 0.526 0.100 3.296 1.648 VAL O -0.500 0.200 2.851 1.425 ASN N -0.520 0.100 3.029 1.515 ASN H 0.248 0.020 1.782 0.891 ASN CA 0.217 0.000 3.296 1.648 ASN CB 0.003 0.100 3.421 1.711 ASN CG 0.675 0.100 3.296 1.648 ASN OD1 -0.470 0.200 2.851 1.425 ASN ND2 -0.867 0.100 3.029 1.515 ASN HD21 0.344 0.020 1.782 0.891 ASN HD22 0.344 0.020 1.782 0.891 ASN C 0.526 0.100 3.296 1.648 ASN O -0.500 0.200 2.851 1.425 GLN N -0.520 0.100 3.029 1.515 GLN H 0.248 0.020 1.782 0.891 GLN CA 0.210 0.000 3.296 1.648 GLN CB 0.053 0.100 3.421 1.711 GLN CG -0.043 0.100 3.421 1.711 GLN CD 0.675 0.100 3.296 1.648 GLN OE1 -0.470 0.200 2.851 1.425 GLN NE2 -0.867 0.100 3.029 1.515 GLN HE21 0.344 0.020 1.782 0.891 GLN HE22 0.344 0.020 1.782 0.891 GLN C 0.526 0.100 3.296 1.648 GLN O -0.500 0.200 2.851 1.425 ARG N -0.520 0.100 3.029 1.515 ARG H 0.248 0.020 1.782 0.891 ARG CA 0.237 0.000 3.296 1.648 ARG CB 0.049 0.100 3.421 1.711 ARG CG 0.058 0.100 3.421 1.711 ARG CD 0.111 0.100 3.421 1.711 ARG NE -0.493 0.100 3.029 1.515 ARG HE 0.294 0.020 1.782 0.891 ARG CZ 0.813 0.100 3.296 1.648 ARG NH1 -0.635 0.100 3.029 1.515 ARG HH11 0.361 0.020 1.782 0.891 ARG HH12 0.361 0.020 1.782 0.891 ARG NH2 -0.635 0.100 3.029 1.515 ARG HH21 0.361 0.020 1.782 0.891 ARG HH22 0.361 0.020 1.782 0.891 ARG C 0.526 0.100 3.296 1.648 ARG O -0.500 0.200 2.851 1.425 HID N -0.520 0.100 3.029 1.515 HID H 0.248 0.020 1.782 0.891 HID CA 0.219 0.000 3.296 1.648 HID CB 0.060 0.100 3.421 1.711 HID CG 0.089 0.100 3.296 1.648 HID ND1 -0.444 0.100 3.029 1.515 HID HD1 0.320 0.020 1.782 0.891 HID CE1 0.384 0.000 3.296 1.648 HID NE2 -0.527 0.100 3.029 1.515 HID CD2 0.145 0.000 3.296 1.648 HID C 0.526 0.100 3.296 1.648 HID O -0.500 0.200 2.851 1.425 HIE N -0.520 0.100 3.029 1.515 HIE H 0.248 0.020 1.782 0.891 HIE CA 0.219 0.000 3.296 1.648 HIE CB 0.060 0.100 3.421 1.711 HIE CG 0.112 0.100 3.296 1.648 HIE ND1 -0.527 0.100 3.029 1.515 HIE CE1 0.384 0.000 3.296 1.648 HIE NE2 -0.444 0.100 3.029 1.515 HIE HE2 0.320 0.020 1.782 0.891 HIE CD2 0.122 0.000 3.296 1.648 HIE C 0.526 0.100 3.296 1.648 HIE O -0.500 0.200 2.851 1.425 HI2 N -0.520 0.100 3.029 1.515 HI2 HN 0.248 0.020 1.782 0.891 HI2 CA 0.195 0.000 3.296 1.648 HI2 CB 0.211 0.100 3.421 1.711 HI2 CG 0.103 0.100 3.296 1.648 HI2 ND1 -0.613 0.100 3.029 1.515 HI2 HND 0.478 0.020 1.782 0.891 HI2 CE1 0.719 0.000 3.296 1.648 HI2 NE2 -0.686 0.100 3.029 1.515 HI2 HNE 0.486 0.020 1.782 0.891 HI2 CD2 0.353 0.000 3.296 1.648 HI2 C 0.526 0.100 3.296 1.648 HI2 O -0.500 0.200 2.851 1.425 TRP N -0.520 0.100 3.029 1.515 TRP H 0.248 0.020 1.782 0.891 TRP CA 0.248 0.000 3.296 1.648 TRP CB 0.020 0.100 3.421 1.711 TRP CG 0.046 0.100 3.296 1.648 TRP CD1 0.117 0.000 3.296 1.648 TRP NE1 -0.330 0.100 3.029 1.515 TRP HE1 0.294 0.020 1.782 0.891 TRP CE2 0.000 0.100 3.296 1.648 TRP CZ2 0.029 0.000 3.296 1.648 TRP CH2 0.034 0.000 3.296 1.648 TRP CZ3 -0.082 0.000 3.296 1.648 TRP CE3 0.145 0.000 3.296 1.648 TRP CD2 -0.275 0.100 3.296 1.648 TRP C 0.526 0.100 3.296 1.648 TRP O -0.500 0.200 2.851 1.425 PHE N -0.520 0.100 3.029 1.515 PHE H 0.248 0.020 1.782 0.891 PHE CA 0.214 0.000 3.296 1.648 PHE CB 0.038 0.100 3.421 1.711 PHE CG 0.011 0.100 3.296 1.648 PHE CD1 -0.011 0.000 3.296 1.648 PHE CE1 0.004 0.000 3.296 1.648 PHE CZ -0.003 0.000 3.296 1.648 PHE CE2 0.004 0.000 3.296 1.648 PHE CD2 -0.011 0.000 3.296 1.648 PHE C 0.526 0.100 3.296 1.648 PHE O -0.500 0.200 2.851 1.425 TYR N -0.520 0.100 3.029 1.515 TYR H 0.248 0.020 1.782 0.891 TYR CA 0.245 0.000 3.296 1.648 TYR CB 0.022 0.100 3.421 1.711 TYR CG -0.001 0.100 3.296 1.648 TYR CD1 -0.035 0.000 3.296 1.648 TYR CE1 0.100 0.000 3.296 1.648 TYR CZ -0.121 0.100 3.296 1.648 TYR OH -0.368 0.100 2.940 1.470 TYR HH 0.339 0.020 1.782 0.891 TYR CE2 0.100 0.000 3.296 1.648 TYR CD2 -0.035 0.000 3.296 1.648 TYR C 0.526 0.100 3.296 1.648 TYR O -0.500 0.200 2.851 1.425 GLU N -0.520 0.100 3.029 1.515 GLU H 0.248 0.020 1.782 0.891 GLU CA 0.246 0.000 3.296 1.648 GLU CB 0.000 0.100 3.421 1.711 GLU CG -0.208 0.100 3.421 1.711 GLU CD 0.620 0.100 3.296 1.648 GLU OE1 -0.706 0.200 2.851 1.425 GLU OE2 -0.706 0.200 2.851 1.425 GLU C 0.526 0.100 3.296 1.648 GLU O -0.500 0.200 2.851 1.425 ASP N -0.520 0.100 3.029 1.515 ASP H 0.248 0.020 1.782 0.891 ASP CA 0.246 0.000 3.296 1.648 ASP CB -0.208 0.100 3.421 1.711 ASP CG 0.620 0.100 3.296 1.648 ASP OD1 -0.706 0.200 2.851 1.425 ASP OD2 -0.706 0.200 2.851 1.425 ASP C 0.526 0.100 3.296 1.648 ASP O -0.500 0.200 2.851 1.425 LYS N -0.520 0.100 3.029 1.515 LYS H 0.248 0.020 1.782 0.891 LYS CA 0.227 0.000 3.296 1.648 LYS CB 0.039 0.100 3.421 1.711 LYS CG 0.053 0.100 3.421 1.711 LYS CD 0.048 0.100 3.421 1.711 LYS CE 0.218 0.100 3.421 1.711 LYS NZ -0.272 0.000 3.296 1.648 LYS HZ1 0.311 0.020 1.782 0.891 LYS HZ2 0.311 0.020 1.782 0.891 LYS HZ3 0.311 0.020 1.782 0.891 LYS C 0.526 0.100 3.296 1.648 LYS O -0.500 0.200 2.851 1.425 PRO N -0.257 0.100 3.029 1.515 PRO CD 0.084 0.100 3.421 1.711 PRO CG 0.036 0.100 3.421 1.711 PRO CB -0.001 0.100 3.421 1.711 PRO CA 0.112 0.000 3.296 1.648 PRO C 0.526 0.100 3.296 1.648 PRO O -0.500 0.200 2.851 1.425 CYS N -0.520 0.100 3.029 1.515 CYS H 0.248 0.020 1.782 0.891 CYS CA 0.146 0.000 3.296 1.648 CYS CB 0.100 0.100 3.421 1.711 CYS SG 0.827 0.200 3.564 1.782 CYS HG 0.135 0.020 1.782 0.891 CYS LP1 -0.481 0.000 2.138 1.069 CYS LP2 -0.481 0.000 2.138 1.069 CYS C 0.526 0.100 3.296 1.648 CYS O -0.500 0.200 2.851 1.425 CYX N -0.520 0.100 3.029 1.515 CYX H 0.248 0.020 1.782 0.891 CYX CA 0.088 0.000 3.296 1.648 CYX CB 0.143 0.100 3.421 1.711 CYX SG 0.824 0.200 3.564 1.782 CYX LP1 -0.405 0.000 2.138 1.069 CYX LP2 -0.405 0.000 2.138 1.069 CYX C 0.526 0.100 3.296 1.648 CYX O -0.500 0.200 2.851 1.425 MET N -0.520 0.100 3.029 1.515 MET H 0.248 0.020 1.782 0.891 MET CA 0.137 0.000 3.296 1.648 MET CB 0.037 0.100 3.421 1.711 MET CG 0.090 0.100 3.421 1.711 MET SD 0.737 0.200 3.564 1.782 MET CE 0.007 0.100 3.564 1.782 MET LP1 -0.381 0.000 2.138 1.069 MET LP2 -0.381 0.000 2.138 1.069 MET C 0.526 0.100 3.296 1.648 MET O -0.500 0.200 2.851 1.425 OME OXT -0.543 0.200 2.851 1.425 ACE CH3 -0.026 0.100 3.564 1.782 ACE C 0.526 0.100 3.296 1.648 ACE O -0.500 0.200 2.851 1.425 NME N -0.520 0.100 3.029 1.515 NME HN 0.248 0.020 1.782 0.891 NME CM 0.272 0.100 3.564 1.782